Los humedales costeros son considerados uno de los sistemas más productivos en el mundo, donde las aves son un componente vistoso y la presencia de algunas especies puede ser útil para la toma de decisiones sobre su conservación. Se buscó caracterizar la avifauna de cinco humedales costeros con la finalidad de encontrar diferencias entre las aves de lagunas y estuario. Para lo anterior, se procedió al análisis de datos propios y de eBird de los últimos diez años (2008 - 2018) de las lagunas Albufera, Llolleo, Cartagena, el Peral y estuario Río Maipo, de la Provincia de San Antonio, Región de Valparaíso. Los resultados muestran que el estuario Río Maipo es la zona con mayor número de especies de aves, residentes, en peligro de extinción y presencia de especies exóticas. La taxocenosis revela que existe una alta similitud entre todos los humedales costeros (Ij > 0.5). Se considera necesario complementar el presente trabajo con un análisis de biocenosis. La Laguna de Llolleo es el humedal de mayor riesgo, debido a la construcción del puerto de gran escala de San Antonio que se proyecta para después del 2020 y que se ubicará adyacente al Humedal Río Maipo.